(最終更新日:2021-06-03 09:53:41)
  ネモト ワタル   NEMOTO Wataru
  根本 航
   所属   東京電機大学  理工学部 理工学科 生命科学系
   東京電機大学  理工学部 理工学科 生命理工学系 ※2018年度学生募集停止
   東京電機大学大学院  先端科学技術研究科 物質生命理工学専攻
   東京電機大学大学院  理工学研究科 生命理工学専攻
   職種   准教授
■ ホームページ
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   情報分子生物学研究室ホームページ(研究紹介等)
   生命科学コース (2018年度より分子生命科学コース) 紹介用動画
   生物環境コース (2018年度より環境生命工学コース) 紹介用動画
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■ 共同研究希望テーマ
1. 創薬標的探索
2. 大規模生物学データ解析
3. 次世代シーケンサーデータ解析
4. 遺伝子・タンパク質・細胞機能改変のための低分子設計
■ 現在の専門分野
生体生命情報学, 生物物理学, システムゲノム科学, 生物多様性 (キーワード:バイオインフォマティクス、タンパク質、膜タンパク質、GPCR、ヘテロダイマー、立体構造、ゲノム解析、トランスクリプトーム解析、創薬、大規模データ、画像解析) 
■ 著書・論文歴
1. 論文  Interface prediction for GPCR oligomerization between transmembrane helices (in press) Methods in Molecular Biology  (共著) 2021 Link
2. 論文  Update of the GRIP web service Journal of Receptors and Signal Transduction 40(4),pp.348-356 (共著) 2020/02 Link
3. 論文  Collaborative environmental DNA sampling from petal surfaces of flowering cherry Cerasus × yedoensis ‘Somei-yoshino’ across the Japanese archipelago Journal of Plant Research  (共著) 2018/02 Link
4. 論文  GGIP: structure and sequence-based GPCR-GPCR interaction pair predictor PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics  (共著) 2016/05 Link
5. その他 膜タンパク質間相互作用ネットワーク制御の試み バイオミディア 93(2),97頁 (単著) 2015/02 Link
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■ 受賞学術賞
1. 2005/03 POSTER AWARD of the year: 14th ScreenTech & TargetTalk 2005
2. 2005/09 POSTER AWARD of chanels and receptors: 15th IUPAB (International Union for Pure and Applied Biophysics Congress) & 5th EBSA (European Biophysics Societies’ Association) Internation
3. 2013/09 Indian Institute of Technology Madaras (IITM) Poster award (2nd prize) of the 2nd IITM – Tokyo Tech Joint Symposium on "Techniques and Applications of Bioinformatics" (FREPS: Functional Region Prediction of a protein by using Spatial statistics)
■ 所属学会
1. 2015~ Biophysical Society
2. 日本生物物理学会
3. 日本蛋白質科学会
4. International Society for Computational Biology
5. 日本バイオインフォマティクス学会
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■ 職歴
1. 2005/04~2005/09 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 情報生命科学専攻 日本学術振興会特別研究員 (DC2)
2. 2005/10~2007/03 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 情報生命科学専攻 日本学術振興会特別研究員 (PD)
3. 2006/02~2007/03 The University of Cambridge Biochemistry Department 日本学術振興会特別研究員 (PD)
4. 2007/04~2012/03 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 産総研特別研究員
5. 2008/04~2012/03 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター JST社会人再教育バイオインフォマティクスコース講師
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■ その他
Gタンパク質間相互作用のためのインターフェイス予測手法 GRIP Link
■ 学歴
1. 2001/04~2003/03 立命館大学大学院 理工学部 環境社会工学専攻 修士課程修了
2. 2003/04~2005/09 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 情報生命科学専攻 博士課程修了 博士(理学)
■ 学会発表
1. 2012/12/15 GPCRs diversify signal transduction pathways through the formation of hetero dimers(日本生化学会)
2. 2013/01/08 GGIP: GPCR-GPCR Interaction Partner prediction(International conference on Biomolecular forms and functions)
3. 2013/07/29 GGIP : GPCR-GPCR Pair prediction(International Conference on Structural Genomics 2013 – Structural Life Science – (ICSG2013-SLS))
4. 2013/09/27 FREPS : Functional REgion Prediction by using Spatial statistics(2nd IITM – Tokyo Tech Joint Symposium on "Techniques and Applications of Bioinformatics")
5. 2013/09/27 GGIP : GPCR-GPCR Interaction Pair prediction(2nd IITM – Tokyo Tech Joint Symposium on "Techniques and Applications of Bioinformatics")
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■ 社会における活動
1. 2015/04~2016/03 バイオインフォマティクス学会技術者認定試験問題作成協力者 Link
2. 2020/01~2020/10 日本生物物理学会第58回年会実行委員
■ 研究課題・受託研究・科研費
1. 2005/04~2007/03  タンパク質間相互作用のためのインタフェースを予測する手法の開発 科学研究費補助金特別研究員奨励費 
2. 2007/10~2010/09  Japan-India Strategic International Cooperative Program 国際共同研究 
3. 2008/04~2010/03  空間統計学を用いた生体情報システムを解析する手法の開発 若手研究(B) 
4. 2010/09~2012/03  微生物DNAに特化したデータ整理法に関する研究 企業からの受託研究 
5. 2011~2012  GPCRオリゴマー化を標的とした創薬に関する研究 企業からの受託研究 
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■ 講師・講演
1. 2006/07 A novel statistical prediction method for multiple candidates of protein-protein interaction interfaces(Wurzburg, Germany)
2. 2006/10 A novel statistical prediction method for functional regions of the proteins of unknown function(STRUBI, WTCHG, Oxford University)
3. 2006/11 A novel statistical prediction method for multiple protein-protein interaction interfaces(Okinawa, Japan)
4. 2006/11 創薬標的としてのGPCRsオリゴマー化と、そ のインターフェイス予測(東京, 日本)
5. 2009/02 相同配列と立体構造を利用したタンパク質機能部位予測(福岡, 日本)
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